Catalogue des examens de laboratoire

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Fiche de l'examen

Titre de l'examen :

CANCER BRONCHOPULMONAIRE (ADNtc): recherche d'altérations moléculaires somatiques

Laboratoire prestataire :

Anatomie pathologique | Infos sur le laboratoire

Document(s) associé(s) à cet examen :

DEMANDE DE BIOMARQUEURS ET DE TESTS MOLECULAIRES -TUMEURS SOLIDES -
Fiche de demande pour la recherche de biomarqueurs et les test moléculaires dans les tumeurs solides à l'Anatomie Pathologique (CHU de Limoges) et la PGMC (Plateforme de Génétique Moléculaire des Cancers du Limousin). Cette fiche de prescription remplace et collige les demandes de tests pour les prélèvements solides et cytologies, les biopsies liquides et les recherches d'altération BRCA/Phénotype HRD.

Technique analytique

Next Generation Sequencing (NGS)

Technique d’extraction : Extraction manuelle de l’ADNtc par QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (Qiagen) Technique d'analyse ciblée: PENTABASE SensiScreen® Ready-to-use FFPE ou PENTABASE SensiScreen® Ready-to-use LIQUID Recherche de mutations somatiques du gène EGFR (NM_005228.5) : exon 18 (p.(Gly719Ala), p.(Gly719Cys), p.(Gly719Ser)), exon 19 (35 délétions (nature non précisée)), exon 20 (p.(Ser768Ile), p.(Thr790Met) + 22 insertions (nature non précisée, non exhaustif), exon 21 (p.(Leu858Arg), p.(Leu861Gln)). Technique d'analyse par NGS: PANEL Custom-cfDNA Liste des cibles : ALK-BRAF-CDK12-CLIP4-EGFR-ERBB2-GSDMB-IKZF3-LBH-KRAS-KIT-MAP2K1-MET-NRAS-PIK3CA-POLE-PTEN- CTNNB1-STARD3-STK11

Remarques particulières

DEROULEMENT DES ANALYSES EN FONCTION DES CASES COCHEES SUR LA FEUILLE DE PRESCRIPTION OPTION 1 :  EGFR Réalisation technique ciblée en urgence (délai 7 jours) - attention les méthodes ciblées peuvent engendrer des résultats faussement négatifs (les panels commerciaux ne permettent pas de détecter l'exhaustivité des mutations) OPTION 2 :  EGFR  Panel NGS ADNtc (dont EGFR-KRAS-ALK) Réalisation technique ciblée en urgence (délai 7 jours) et NGS en parallèle (délai 7 à 15 jours) OPTION 3 :  Panel NGS ADNtc (dont EGFR-KRAS-ALK) Réalisation NGS seul (délai 7 à 15 jours)

Tube(s) ou récipient(s) correspondant :

2 X		AUTRE	Tube Cell-Free DNA Collection ROCHE

Volume minimal nécessaire :

2 tubes Cell-Free DNA Collection (ROCHE) de 9mL chacun

Conditions de prélèvement :

Acheminer les tubes dans un délai de 7 jours maximum

Conditions d'acheminement

A température ambiante

Les délais annoncés partent de la date à laquelle la plateforme reçoit le prélèvement (ils ne prennent pas en compte le délai de transmission du prélèvement par le laboratoire d'anatomo-pathologie ou de biologie)

Délai de réalisation

de 7 à 15 jours

Temps de rendu maximal

de 7 à 15 jours

Mise en thèque

Oui

Examen pouvant être réalisé en urgence :

Oui

Cotation :	HN
Code cotation :	4 x N408 + N006 + N452
Prix :	HN 5250 (1417.5 €)

Informations complémentaires au sujet de la cotation de cet examen :

OPTION 1 : N006 + N408 (X4) - réalisation technique ciblée en urgence  EGFR OPTION 2 : N006 + N408 (X4) + N542 -réalisation technique ciblée en urgence + NGS  EGFR  Panel NGS ADNtc (dont EGFR-KRAS-ALK) OPTION 3 : N006 + N542 -réalisation du NGS SEUL  Panel NGS ADNtc (dont EGFR-KRAS-ALK)

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