Catalogue des examens de laboratoire

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Fiche de l'examen

Titre de l'examen : CANCERS BRONCHOPULMONAIRES (Tissus solides) : recherche d'altérations moléculaires somatiques
Laboratoire prestataire : Anatomie pathologique | Infos sur le laboratoire
Document(s) associé(s) à cet examen :
DEMANDE DE BIOMARQUEURS ET DE TESTS MOLECULAIRES -TUMEURS SOLIDES -
Fiche de demande pour la recherche de biomarqueurs et les test moléculaires dans les tumeurs solides à l'Anatomie Pathologique (CHU de Limoges) et la PGMC (Plateforme de Génétique Moléculaire des Cancers du Limousin). Cette fiche de prescription remplace et collige les demandes de tests pour les prélèvements solides et cytologies, les biopsies liquides et les recherches d'altération BRCA/Phénotype HRD.

Technique analytique Next Generation Sequencing (NGS)

SEQUENCAGE NGS ADN : Extraction d'ADN génomique par Méthode automatique (Maxwell16 ; Promega) Technique analytique utilisée : Enrichissement par Capture (Agilent) Liste des gènes analysés: AKT1, ALK, BRAF, CTNNB1, EGFR, ERBB2, ERBB4, FGFR1, FGFR2 FGFR3, GNAS, IDH1, IDH2, KEAP1, KRAS, KIT, MET, NRAS, PIK3CA, PDGFRA, POLE, STK11, TP53 SEQUENCAGE NGS ARN : Technique d’extraction : Maxwell RSC RNA FFPE Kit – Promega sans DNase Technique analytique utilisée : panel Archer FusionPlex® Lung(ArcherDX) Liste des gènes analysés: ALK, BRAF, EGFR, ERBB2, FGFR1, FGFR2, FRGR3, KRAS, MET, NRG1, NTRK1, NTRK2, NTRK3,NUTM1, PIK3CA, RET, ROS1
Matrice biologique : FFPE
Remarques particulières DEROULEMENT DES ANALYSES EN FONCTION DES CASES COCHEES SUR LA FEUILLE DE PRESCRIPTION Quelques soient les options cochées : Réalisation de l'ensemble des technique NGS ADN et NGS ARN simultanément pour la recherche de biomarqueurs de première intention EGFR, KRASG12C, BRAF, HER2, Metintron14 (NGS ADN, délai 7 jours) et ALK, ROS-1, NTRK, RET (NGS ARN, délai 15 jours)

Tube(s) ou récipient(s) correspondant :
1 X AUTREBloc FFPE
Conditions de prélèvement : Joindre obligatoirement: - la fiche de prescription dument remplie dans l'ensemble des champs - le compte-rendu d'anatomie pathologique - le prélèvement tumoral +/- un prélèvement de tissu non tumoral - une lame HES de sortie représentative du prélèvement, avec le pourcentage de cellules tumorales sur lame entière indiqué sur la fiche de prescription et si celui-ci est inférieur à 20%, une zone plus riche en cellules tumorale, correctement cerclée sur la lame, et dont le pourcentage doit être indiqué sur cette lame et sur la fiche de prescription.
Conditions d'acheminement A température ambiante


Les délais annoncés partent de la date à laquelle la plateforme reçoit le prélèvement (ils ne prennent pas en compte le délai de transmission du prélèvement par le laboratoire d'anatomo-pathologie ou de biologie)

Délai de réalisation de 7 à 15 jours
Temps de rendu maximal de 7 à 15 jours
Mise en thèque Oui
Examen pouvant être réalisé en urgence : Oui

Cotation : HN
Code cotation : N536 + N530 + 2 x N005 + N452 + N453
Prix : HN 10060 (2716.2 €)
Informations complémentaires au sujet de la cotation de cet examen : EN FONCTION DE LA DEMANDE: OPTION 1 : N005 (X 2) + N453  Panel NGS ADN (dont EGFR-KRAS-BRAF-ERBB2-PIK3CA-STK1-KEAP1-TP53...)  Panel Fusion ARN (dont ALK, ROS-1, NTRK1/2/3, RET, METex14...)  ALK (IHC/NGS ARN/Biocartis)  ROS-1 (IHC/NGS ARN/Biocartis) Option 2 : N005 (X 2) + N453  Panel NGS ADN (dont EGFR-KRAS-BRAF-ERBB2-PIK3CA-STK1-KEAP1-TP53...)  Panel Fusion ARN (dont ALK, ROS-1, NTRK1/2/3, RET, METex14...) Option 3 : N005 + N452 + N530 + N536  Panel NGS ADN (dont EGFR-KRAS-BRAF-ERBB2-PIK3CA-STK1-KEAP1-TP53...)  ALK (IHC/NGS ARN/Biocartis)  ROS-1 (IHC/NGS ARN/Biocartis)



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